Hàng thuỷ sản XNK

Kính thưa Luật sư!
Công ty chúng tôi có hoạt động về lĩnh vực xuất, nhập khẩu thủysản đông lạnh. Sắp đến chúng tôi sẽ ký hợp đồng mua một lô hàng thủy sản với 1 Công ty A (nước ngoài) ở Malaysia, sau đó chúng tôi bán ngay lô hàng trên cho một Công ty B ở Nhật Bản.
Theo trình tự, chúng tôi phải nhập khẩu lô hàng trên về Việt Nam sau đó làm xuất khẩu lô hàng đó sang Nhật thì thủ tục và chứng từ sẽ đủ điều kiện hưởng thuế suất thuế GTGT là 0%. 
Để tiết kiệm chi phí vận tải đường biển, chúng tôi muốn xuất từ cảng của Malaysia đến thẳng cảng của Nhật để giao cho Công ty B. Như vậy Công ty chúng tôi chỉ có các giấy tờ sau :
Nhập khẩu (hình thức thanh toán : TTR):
- Tờ khai hải quan tại cảng Malaisia (bản pho to).
- Invoice, packing list, hợp đồng (bản chính).
- Bill (bản photo) : cảng đi : Malaisia, cảng đến : Nhật .
Xuất khẩu (hình thức thanh toán : L/C) :
- Invoice, packing list, hợp đồng (bản chính).
- Tờ khai nhập khẩu của Công ty B (Nhật) (bản photo). 

Kính thưa Lật sư! Như vậy Công ty chúng tôi có được hưởng thuế suất thuế GTGT 0% (xuất khẩu) không? Nếu được, ngoài những thủ tục trên Công ty chúng tôi cần bổ sung chứng từ nào nữa không?   
Chúng tôi xin thành thật cảm ơn.