Tranh chấp trong giao kết hợp đồng mua bán hàng hóa?

Cty A muốn đặt mua dây chuyền chế biến hạt cà phê. Cty A đã giao kết hợp đồng với cty cơ khí B, theo đó cty B sẽ nghiên cứu, thiết kế, sản xuất và lắp đặt dây chuyền chế biến hạt cà phê cho ty A trong thời gian 1 tháng, với những thông số kỹ thuật do cty A cung cấp. Cty B đã gửi bản hợp đồng cho công ty A và Tổng giám đốc cũng là người đại diện của công ty A đã kí tên vào bản hợp đồng. Hai bên đã hoàn tất việc giao kết hợp đồng.

Trong thời gian cty B thực hiện việc nghiên cứu, thiết kế, sản xuất dây chuyền này thì cty A biết được thông tin trên thị trường đã xuất hiện một dây chuyền chế biến hạt cà phê có những đặc tính ưu việt hơn so với dây chuyền mà cty B đang sản xuất, mà giá cả lại ngang với chi phí sản xuất của cty B đưa ra. Do đó cty A muốn từ chối sản phẩm của cty B.

Ngày bàn giao dây chuyền, cty A lấy lý do Tổng giám đốc đã kí tên vào hợp đồng nhưng chưa đóng dấu, cho nên bản hợp đồng không có giá trị pháp lý, không có hiệu lực. Do đó cty A không nhận dây chuyền từ cty B.

Vậy lập luận của cty A có hợp pháp không? Cty B phải làm gì để bảo vệ quyền lợi của mình? 

Mong nhận được sự giải đáp của mọi người. Xin cảm ơn.