Thuế TNCN của cá nhân cư trú làm việc ở 2 nơi

Xin hỏi Luật sư, trường hợp cụ thể như sau:

Anh A hiện đang ký hợp đồng với 2 đơn vị :

- Cơ quan B (một cơ quan nghiên cứu của NN), ký HĐLĐ, đóng BHXH, BHYT với mức lương theo hệ số 2.67 - thực chất là tự đóng BH toàn bộ;

- Công ty TNHH... C: Ký HĐLĐ với mức lương 9 tr; Cuối năm 2012 đã quyết toán thuế TNCN tại cty C, giảm trừ gia cảnh tại cty C;

Bây giờ, Cơ quan B muốn ký Hợp đồng thuê khoán chuyên môn (18 tr) với anh A.

Tôi có mấy vấn đề muốn hỏi như sau:

- Cơ quan B nói rằng anh A đã quyết toán thuế tncn với Cty C nên đối với cơ quan B, anh A là người ngoài đơn vị -> phải nộp thuế tncn 10%/tổng giá trị HD TKCM (tức là 1,8tr) - trừ thẳng từ HD TKCM, thì có đúng không?

- Nếu tính anh A là người của cơ quan B thì việc quyết toán thuế tncn ở Cty C có ảnh hưởng gì không?

- Xin Luật sư tư vấn giúp xem làm thế nào để có lợi nhất cho người lao động?

Mong sớm nhận được giải đáp của Luật sư!

Tôi xin trân thành cảm ơn Luật sư!