Thuế GTGT đầu vào đối với dự án nhà nước giao đất đổi cơ sở hạ tầng

Thuế GTGT đầu vào của dự án đổi đất lấy cơ sở hạ tầng:
Doanh nghiệp được nhà nước giao đất làm đường, quy hoạch dân cư 2 bên đường và Nhà nước trả tiền bằng cách doanh nghiệp bán đất 2 bên đường, Doanh nghiệp bán đất theo giá thị trường. Phần giá đất UBND tỉnh quy định phải nộp Nhà nước đã bao gồm toàn bộ chi phí đầu tư dự án (Theo QĐ của UBND tỉnh), (Nộp tiền đất vào Ngân sách sau đó Ngân sách trả lại tiền xây dựng cơ sở hạ tầng hoặc ghi thu ghi chi, nếu còn phải nộp thì trả nhà nước). Khi đó hoá đơn đầu ra của doanh nghiệp phải ghi giá trị tính thuế GTGT = Số tiền thu về từ bán đất - (trừ) giá đất nộp Nhà nước.
Vậy, Thuế GTGT đầu vào của dự án (phần làm đường, nền) có được kê khai khấu trừ và hoàn thuế GTGT không?
Rất mong Luật sư và các bạn tư vấn sớm giúp tôi. Tôi xin trân thành cảm ơn.