Tại Khoản 2 Điều 24 Nghị định số 16/2015/NĐ-CP quy định:
"2. Trong khi chưa ban hành hoặc sửa đổi Nghị định quy định cơ chế tự chủ của đơn vị sự nghiệp công trong từng lĩnh vực cụ thể theo quy định tại Khoản 1 Điều này, các đơn vị sự nghiệp công theo từng lĩnh vực được tiếp tục thực hiện cơ chế tự chủ theo quy định tại Nghị định số 43/2006/NĐ-CP ..."
Theo đó, đơn vị anh có thể áp dụng Nghị định 43 vào thời điểm hiện tại. Nghị định 43 có quy định như sau:
"Điều 25. Tiền lương, tiền công và thu nhập
...
2. Nhà nước khuyến khích đơn vị sự nghiệp tăng thu, tiết kiệm chi, thực hiện tinh giản biên chế, để tăng thêm thu nhập cho người lao động trên cơ sở hoàn thành nhiệm vụ được giao, sau khi thực hiện đầy đủ nghĩa vụ với ngân sách nhà nước.
Căn cứ kết quả tài chính, số kinh phí tiết kiệm được; đơn vị được xác định tổng mức chi trả thu nhập trong năm của đơn vị tối đa không quá 2 lần quỹ tiền lương cấp bậc, chức vụ do nhà nước quy định.
Việc chi trả thu nhập cho từng người lao động trong đơn vị thực hiện theo nguyên tắc: người nào có hiệu suất công tác cao, đóng góp nhiều cho việc tăng thu, tiết kiệm chi được trả nhiều hơn. Thủ trưởng đơn vị chi trả thu nhập tăng thêm theo quy chế chi tiêu nội bộ của đơn vị."
Điều này được hướng dẫn bởi Khoản 3 Mục 9 Công văn 3772/BNV-KHTC (anh xem chi tiết tại văn bản).
Theo đó, trường hợp của anh, việc có được hưởng thu nhập tăng thêm hay không thì phải xem lại quy chế chi tiêu nội bộ để xác định điều kiện được hưởng thu nhập. Nếu anh đi học mà vẫn đóng góp nhiều cho đơn vị thì có thể được xem xét trả thêm thu nhập.