Mất phiếu thu có được xem xét cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất?

Năm 1991, bác tôi có làm đơn xin đất ở tại địa phương. Chủ tịch UBND xã lúc bấy giờ có chấp thuận và xác nhận vào đơn xin cấp đất ở của bác tôi. Do điều kiện công việc, bác tôi không có mặt thường xuyên tại địa phương nên có nhờ bố tôi đóng lệ phí đất. Ngày 30/04/1992, bố tôi đóng 500.000 đồng lệ phí cho UBND xã và được giao lại phiếu thu liên 2. Ngày 22/05/1995, bác tôi được bàn giao 200 m2 đất ở, trong biên bản có xác định rõ thửa đất, tờ bản đồ, ranh giới sử dụng đất nhưng là loại đất màu. Năm 2000, UBND xã thông báo có kế hoạch kiểm tra đất ở khi bắt đầu nhiệm kỳ mới, bác tôi đã gửi phiếu thu tiền đất nói trên cho cán bộ địa chính xã và UBND xã. Sau đó, phiếu thu của bác tôi được trả lời đã bị thất lạc, do đó, bác tôi không thể thực hiện thủ tục xin cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất đối với thửa đất  nêu trên. Hiện tại, trên mảnh đất của bác tôi chưa có nhà ở, trước đây chỉ sử dụng để trồng hoa màu. Khu đất này hiện không có tranh chấp với ai.

Xin hỏi trường hợp bị mất phiếu thu, chỉ còn biên bản bàn giao đất ở có làm thủ tục xin cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất được không? UBND xã từ chối giải quyết như vậy là đúng hay sai? Xin cảm ơn.