Lệ phí trước bạ tài sản trên đất đang trong quá trình xin miễn tiền thuê đất

Thưa Luật sư,

Công ty tôi có thuê đất trả tiền thuê hàng năm để thực hiện dự án và đã được cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất (miễn lệ phí trước bạ đất) Tuy nhiên, Công ty đang trong quá trình xin miễn tiền thuê đất đối với dự án thuộc lĩnh vực xã hội hóa. Năm 2015, chúng tôi đã thực hiện xây dựng tài sản trên đất và tiến hành đăng ký bổ sung tài sản này vào Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất. Sở Tài nguyên môi trường đã chuyển hồ sơ qua Cục Thuế yêu cầu xác định nghĩa vụ tài chính (lệ phí trước bạ). Tuy nhiên Cục Thuế có công văn trả lời là chưa thể xác định được vì đến bây giờ Công ty chúng tôi vẫn chưa có quyết định cuối cùng về tiền thuê đất, do đó nghĩa vụ tài chính trên đất là chưa thực hiện xong. 

Vậy, Luật sư cho hỏi, lý  do Cục Thuế  đưa ra như vậy có chính xác hay không? Lệ phí trước bạ đối với tài sản trên đất có phải chịu ảnh hưởng từ tiền thuê đất hay không? Bởi vì trường hợp nếu có quyết định từ thủ tướng mà công ty phải nộp tiền thuê đất thì công ty sẽ nộp lại ngay từ đầu cho đến nay.

Mong nhận được câu trả lời từ Luật Sư. Chân thành cảm ơn