làm hợp đồng như vậy có hợp lý

Xin chào luật sư. tôi xin hỏi 1 việc như sau: từ tháng 10/2010 ông giám đốc công ty tôi(khi đó chưa thành lập công ty vẫn kinh doanh cá thể) thuê mảnh đất đến tháng 10/2014( thời hạn 5 năm).ông GĐ tôi đã làm hợp đồng thuê đất trên( Hợp đồng số 01) với chủ mảnh đất và đã ra xã nơi có mảnh đất xin xác nhận. Đến ngày 21/06/2011 có GNCN Đăng ký Kinh Doanh công ty Cổ Phần( giám đốc tôi góp vốn với 3 người khác nữa). Văn phòng công ty tôi vẫn trên mảnh đất thuê này.Chúng tôi đã làm 1 biên bản hủy HĐ hợp đồng số 01 ngày 30/06/2011. và làm lại hợp đồng thuê ( HĐ số 02)  mảnh đất đó ( vì bây giờ là công ty thuê chứ không phải cá nhân thuê nữa). HĐ này ký ngày 01/07/2011 và có thời hạn 10 năm.Khi hủy hợp đồng và ký hợp đồng mới chúng tôi không mang ra xã xác nhận.đến ngày 20/05/2012 tôi mới mang hợp đồng ra và biên bản hợp đồng ra xã xin xác nhận. Cán bộ tư pháp tại xã đó nói chúng tôi lấp liếm hợp đồng và không đồng ý xác nhận cho. Vậy tôi xin hỏi chúng tôi làm thế có sai luật không? và xin luật sư nêu rõ văn bản pháp luật hướng dẫn. trân trọng cảm ơn!