Kê khai thuế GTGT theo phương pháp trực tiếp

Chào luật sư,

Do doanh thu bên công ty em đạt ngưỡng dưới 1 tỷ đồng, và theo thông tư số 156/2013/TT-BTC quy định, công ty em chuyển sang tính thuế theo phương pháp trực tiếp, vậy luật sư cho em hỏi là khi khai thuế GTGT theo mẫu số 04/GTGT (tính thuế theo phương pháp trực tiếp trên doanh thu) thì phần tổng doanh thu bán hàng chịu thuế GTGT là tổng giá trị ghi trên hóa đơn thông thường hay là tổng giá trị trên hóa đơn thông thường chia cho mức thuế suất ạ? Và em cũng muốn hỏi thêm là: bên em có ký hợp đồng dịch vụ dài hạn, hàng quý có xuất hóa đơn GTGT (năm 2013 trở về trước, công ty em tính thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ) nay chuyển sang tính thuế GTGT theo phương pháp trực tiếp thì có ảnh hưởng gì không ạ?

Em cám ơn luật sư.