Hơp đồng thuê khoán chuyên môn

Chào luật sư, 

Công ty em làm về lĩnh vực nước và môi trường, Có những nội dung trong đề tài cần phải thuê khoán chuyên môn. Công ty đã ứng tiền trước cho chủ nhiệm đề tài thực hiện nội dung đó. Chủ nhiệm sẽ thuê khoán ai, và trả lương thuê khoán cho chuyên gia đó như thế nào là thoả thuận của chủ nhiệm và chuyên gia.Nhưng trong hợp đồng thuê khoán lại để bên giao khoán là công ty em, người đại diện là giám đốc và chủ nhiệm đề tài, như vậy công ty em có phải khấu trừ thuế TNCN cho những chuyên gia đó không? Bởi vì công ty đã giao trọn phần chi phí đó cho chủ nhiệm đề tài nên em không biết công ty có phải khấu trừ thuế TNCN phần chi phí đó không,mong luật sư giải đáp giúp.