Hỏi về thủ tục hải quan xây dựng công trình trong khu CX

Công ty chúng tôi cũng đang chuẩn bị ký hợp đồng với 1 đơn vị trong khu chế xuất để thực hiện trọn gói công trình "Cung cấp và lắp đặt hoàn chỉnh hệ thống Điện cho nhà xưởng trong khu chế xuất", để tìm hiểu về điều kiện xuất hoá đơn VAT 0% chúng tôi đã tìm hiểu trong Thông tư 32/2007/TT-BTC ngày 9/4/2007 và Thông tư 129/2008 ngày 26/12/2008 thì hiểu rằng thi công, lắp đặt công trình trong khu chế xuất thì không cần khai báo hải quan vì đây thuộc về lĩnh vực Dịch vụ. Tìm hiểu trên mạng, một số diễn đàn kế toán, kể cả trang tư vấn này (http://danluat.thuvienphapluat.vn/forums/default.aspx?ct=TVQD&id=19769) thì đều khẳng định là không cần khai báo hải quan. Tuy nhiên khi chúng tôi làm Công văn gởi cho Chi cục thuế sở tại thì cơ quan thuế trả lời là cần phải có tờ khai hải quan, sau đó chúng tôi đến trực tiếp phòng thông tin tuyên truyền cuả Chi cục thuế là nơi trả lời thắc mắc và sau quá trình trao đổi thì bên đó trả lời là phần vật tư, thiết bị phải khai báo; nhân công thì không khai báo. Tuy nhiên theo đặc thù cuả công việc chúng tôi không biết phải khai báo như thế nào, kể cả cơ quan hải quan nơi doanh nghiệp chế xuất cũng không hướng dẫn khai báo được. Vì vậy, một lần nữa, thông qua diễn đàn này, tôi kính nhờ Qúy vị tư vấn giúp một số thắc mắc cuả chúng tôi:
1. Trong trường hợp cuả chúng tôi có cần khai báo hải quan hay không (tức là khai báo vật tư, thiết bị) hay là hoàn toàn không cần khai báo;
2. Nếu không phải khai báo thì sau này thuế VAT đầu vào cuả chúng tôi sẽ được khấu trừ hoặc hoàn thuế ra sao?
3. Một khi cơ quan quản lý thuế trực tiếp cuả doanh nghiệp chúng tôi vẫn hiểu 2 thông tư nói trên theo nghiã phải khai báo thì sau này nếu chúng tôi không khai báo Hải quan mà vẫn xuất hoá đơn 0% thì khi quyết toán thuế, nếu cơ quan thuế đòi hỏi tờ khai hải quan thì chúng tôi phải làm sao?

Chân thành cám ơn Qúy vị.