Hỏi về phương pháp tính thuế cho đơn vị sự nghiệp tự chủ hoàn toàn

Xin chào Quý Luật sư!

Đơn vị tôi là Khu bảo tồn thiên nhiên Nam Nung, đơn vị sự nghiệp công lập thực hiện tự chủ hoàn toàn từ năm 2018. Hiện tại nguồn thu chúng tôi vừa có ngân sách cấp cho bộ phận hành chính, và nguồn thu từ nguồn dịch vụ môi trường rừng dùng cho bộ phận sự nghiệp (nguồn tự chủ). Tuy nhiên nguồn dịch vụ môi trường rừng này không chịu thuế GTGT nhưng chịu thuế TNDN. Vậy bên tôi có thể đăng ký thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ không? Vì chi phí đầu vào thì xác định được nhưng không có phát sinh thuế GTGT đầu ra và không sử dụng hóa đơn GTGT. Nếu đăng ký thuế theo phương pháp khấu trừ thuế thì có được hoàn thuế GTGT không?

Rất mong được Quý Luật sư tư vấn hỗ trợ. 

Xin chân thành cảm ơn