Hàng hóa ngoại nhập vận chuyển không hóa đơn là hàng lậu?

Doanh nghiệp (DN) chúng tôi, thời gian vừa qua có kinh doanh, bán một lô hàng ngoại nhập. Số hàng hóa ngoại nhập của DN bán cho khách hàng ở địa phương khách  được vận chuyền bằng xe tải để đi giao hàng.
Trên đường vận chuyển giao hàng thì bị lực lượng Quản lý thị trường (QLTT) kiểm tra. Tại thời điểm cơ quan QLTT kiểm tra hàng hóa của DN, thì DN không có hóa đơn GTGT kèm theo hàng hóa. Toàn bộ hàng hóa bị cơ quan QLTT lập biên bản tạm giữ để xử lý.
Ngày hôm sau, tôi đến xuất trình toàn bộ hóa đơn GTGT liên quan đến lô hàng của DN bị tạm giữ cho cơ quan QLTT. Sau khi làm việc, thì cơ quan QLTT kết luận toàn bộ sô hàng ngoại nhập của DN chúng tôi là hàng nhập lậu vì theo qui định hàng ngoại nhập khi vận chuyển trên phương tiện giao thông phải kèm theo hóa đơn, chứng từ (bản chính), nếu vi phạm sẽ bị xử lý là hàng nhập lậu.
DN chúng tôi đã bị xử lý vi phạm hành chính bằng tiền và còn bị tịch thu toàn bộ hàng hóa.
Liệu kết quả xử lý của cơ quan QLTT như vậy là đúng hay sai?