Chào bạn! do nội dung bạn nêu không rõ nên tôi không thể tư vấn cụ thể cho bạn được, tuy nhiên liên quan đến vấn đề này tôi cũng có một số ý kiến mà bạn có thể tham khảo thêm như sau:
Theo quy định của pháp luật thì với các loại thuế khai theo tháng, quý hoặc năm, nếu trong kỳ tính thuế không phát sinh nghĩa vụ thuế hoặc người nộp thuế đang thuộc diện được hưởng ưu đãi, miễn giảm thuế thì người nộp thuế vẫn phải nộp hồ sơ khai thuế cho cơ quan thuế theo đúng thời hạn quy định, trừ trường hợp đã chấm dứt hoạt động phát sinh nghĩa vụ thuế và trường hợp tạm ngừng kinh doanh, riêng với thuế môn bài thì dù doanh nghiệp tạm ngưng hoạt động vẫn phải nộp thuế môn bài theo quy định
Và cũng theo quy định của pháp luật, trong trường hợp người nộp thuế không nộp hồ sơ khai thuế; nộp hồ sơ khai thuế sau chín mươi ngày, kể từ ngày hết thời hạn nộp hồ sơ khai thuế hoặc ngày hết thời hạn gia hạn nộp hồ sơ khai thuế theo quy định thì sẽ bị xử phạt về hành vi trốn thuế.
Như vậy đối với trường hợp của công ty bạn thì phía công ty bạn đã vi phạm quy định pháp luật về kê khai và nộp thuế, do đó tuỳ từng trường hợp và mức độ mà phía cơ quan thuế sẽ có biện pháp xử lý. Tuy nhiên theo tôi bạn nên liên hệ với cơ quan quản lý thuế để tìm hiểu thông tin về trường hợp này.
Trân trọng!