Về vấn đề của bạn thì mình có nghiên cứu và chia sẻ một số thông tin sau:
"Điều 9. Thời điểm lập hóa đơn
1. Thời điểm lập hóa đơn đối với bán hàng hóa (bao gồm cả bán tài sản nhà nước, tài sản tịch thu, sung quỹ nhà nước và bán hàng dự trữ quốc gia) là thời điểm chuyển giao quyền sở hữu hoặc quyền sử dụng hàng hóa cho người mua, không phân biệt đã thu được tiền hay chưa thu được tiền."
Theo đó, thời điểm lập hóa đơn trong trường hợp bán xe là thời điểm chuyển giao quyền sở hữu/sử dụng chiếc xe cho khách hàng, không phân biệt đã thu được tiền hay chưa thu được tiền. Vì vậy, dù chỉ nhận thanh toán trước 50% thì đơn vị bạn vẫn có thể xuất hóa đơn cho khách hàng khi bàn giao xe để họ có thể làm thủ tục đăng ký nhằm hưởng ưu đãi thuế.
Vấn đề khó ở đây là đại lý của bạn chưa bàn giao xe, chưa chuyển quyền sở hữu/sử dụng xe cho khách hàng mà để tại cửa hàng cho đến ngày 5/6 nên việc lập hóa đơn lúc này sẽ không phù hợp với quy định. Do đó, đơn vị bạn cần lưu ý vấn đề này.
Đối với thỏa thuận trong hợp đồng, như đã phân tích ở trên thì thời điểm thanh toán không ảnh hưởng đến việc xuất hóa đơn. Do đó, đơn vị chỉ cần làm rõ các thỏa thuận trong hợp đồng liên quan đến vấn đề thanh toán. Ví dụ như thời hạn thanh toán đợt hai, điều kiện thanh toán, phương thức thanh toán, xử lý khi vi phạm nghĩa vụ thanh toán, tiền chậm trả,...