Xây dựng công trình trong hợp đồng hợp tác kinh doanh?

Kính chào luật sư.

Tôi có 1 vấn đề muốn được tư vấn từ các luật sư như sau:

Công ty tôi ( Bên B) có ký hợp đồng hợp tác đầu tư với Cty đối tác ( Bên A). Bên A góp vốn bằng quyền sử dụng đất và tài sản trên đất. Hiện, quyền SD đất và tài sản trên đất của bên A đang thế chấp tại ngân hàng. Ngân hàng đã đồng ý cho phá dỡ tài sản để thay thế và được dùng tài sản mới để hợp tác kinh doanh. Bên B ( cty tôi) là người phải bỏ mọi chi phí liên quan đến việc xây dựng tài sản mới trên khu đất đó. Bên A làm giấy phép xây dựng. Sau khi hoàn thành công trình, bên B sẽ bàn giao tài sản cho bên A, tài sản sẽ mang tên bên A ( giấy tờ chủ sở hữu công trình mang tên bên A). Bên B sẽ có quyền sử dụng tài sản đó của bên A để hoạt động kinh doanh.

Tôi muốn hỏi việc bên B ký kết các hợp đồng với nhà thầu có được không? Các khoản thuế VAT đầu vào Bên B có được khấu trừ không? ( Có HĐ và chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt)

Sau khi hoàn thành công trình bên B có làm thủ tục hoàn công được không?

Bên B sẽ bàn giao lại cho bên A như thế nào cho đúng và hợp lý?

Rất mong nhận được tư vấn của luật sư. 

Trân trọng cám ơn.