Chào bạn, với câu hỏi của bạn thì mình xin trả lời như sau:
1. Về kê khai thuế GTGT cho chi nhánh
Theo quy định tại điểm b khoản 4 điều 12 thông tư 219/TT-BTC, được sửa đổi bổ sung bởi thông tư 119/2014/TT-BTC thì:
"Đối với doanh nghiệp đang nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có thành lập chi nhánh (bao gồm cả chi nhánh được thành lập từ dự án đầu tư của doanh nghiệp), nếu chi nhánh thuộc trường hợp khai thuế GTGT riêng theo quy định của pháp luật về quản lý thuế thì xác định phương pháp tính thuế của Chi nhánh theo phương pháp tính thuế của doanh nghiệp đang hoạt động. Trường hợp chi nhánh không trực tiếp bán hàng, không phát sinh doanh thu hoặc chi nhánh ở địa phương cấp tỉnh, thành phố cùng nơi doanh nghiệp có trụ sở chính nhưng không thực hiện kê khai riêng thì thực hiện khai thuế tập trung tại trụ sở chính của doanh nghiệp."
Và theo quy định tại điểm c khoản 1 điều 11 thông tư 156/2013/TT-BTC thì: "Trường hợp người nộp thuế có đơn vị trực thuộc kinh doanh ở địa phương cấp tỉnh khác nơi người nộp thuế có trụ sở chính thì đơn vị trực thuộc nộp hồ sơ khai thuế giá trị gia tăng cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp của đơn vị trực thuộc; nếu đơn vị trực thuộc không trực tiếp bán hàng, không phát sinh doanh thu thì thực hiện khai thuế tập trung tại trụ sở chính của người nộp thuế."
Như vậy, nếu như chi nhánh của công ty bạn có trực tiếp bán hàng, có phát sinh doanh thu thì kê khai thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ cho cơ quan quản lý thuế trực tiếp (chi cục thuế nơi chi nhánh đóng trụ sở)
2. Về việc sử dụng hóa đơn GTGT cho chi nhánh
Theo quy định tại khoản 4 điều 9 văn bản hợp nhất số17/VBHN/2015/BTC thì: "...Trường hợp tổ chức có các đơn vị trực thuộc, chi nhánh có sử dụng chung mẫu hóa đơn của tổ chức nhưng khai thuế giá trị gia tăng riêng thì từng đơn vị trực thuộc, chi nhánh phải gửi Thông báo phát hành cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp. Trường hợp tổ chức có các đơn vị trực thuộc, chi nhánh có sử dụng chung mẫu hóa đơn của tổ chức nhưng tổ chức thực hiện khai thuế giá trị gia tăng cho đơn vị trực thuộc, chi nhánh thì đơn vị trực thuộc, chi nhánh không phải Thông báo phát hành hóa đơn...."
Như vậy, Chi nhánh của công ty hoàn toàn có quyền sử dụng chung mẫu hóa đơn GTGT với công ty.
3. Về lệ phí môn bài
Theo quy định tại nghị định 139/2016 thì địa điểm kinh doanh là đối tượng phải nộp lệ phí môn bài với mức phải nộp là 1.000.000 đồng/năm, nếu địa điểm kinh doanh lập từ ngày 01/07 trở đi thì năm đó chỉ phải nộp 500.000 đồng. Thời hạn kê khai và nộp lệ phí môn bài là 30 ngày kể từ ngày được cấp giấy chứng nhận đăng ký thành lập địa điểm kinh doanh.
Trên đây là toàn bộ nội dung trả lời cho những câu hỏi của bạn, hy vọng sẽ giải đáp được thắc mắc của bạn, nếu còn điều gì chưa rõ thì liên hệ với mình qua số điện thoại: 0979 473 688
-----
Trân trọng.
Nguyễn Bá Hưng - Luật Sư
DĐ: 0979 473 688 - Email: Hunggialuat@gmail.com
CÔNG TY TNHH LUẬT HƯNG GIA
311-M21 Đường số 7, P.An Phú, Quận 2, HCM
CN: 349 Bùi Trọng Nghĩa, Kp3, Trảng Dài, Biên Hoà, Đồng Nai.