Trường hợp này nếu xét theo vị trí pháp lý thì các công ty này là các pháp nhân độc lập với nhau, quan hệ mẹ - con chỉ là quan hệ ràng buộc về vấn đề vốn trong đó. Theo quy định hiện hành tại khoản 7 Điều 5 Thông tư 219/2013/TT-BTC thì:
"Điều 5. Các trường hợp không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT
...
7. Các trường hợp khác:
Cơ sở kinh doanh không phải kê khai, nộp thuế trong các trường hợp sau:
...
a) Góp vốn bằng tài sản để thành lập doanh nghiệp. Tài sản góp vốn vào doanh nghiệp phải có: biên bản góp vốn sản xuất kinh doanh, hợp đồng liên doanh, liên kết; biên bản định giá tài sản của Hội đồng giao nhận vốn góp của các bên góp vốn (hoặc văn bản định giá của tổ chức có chức năng định giá theo quy định của pháp luật), kèm theo bộ hồ sơ về nguồn gốc tài sản."
=> Không cần phải xuất hóa đơn, không phải kê khai, nộp thuế GTGT.
Ngoài ra, anh có thể tham khảo thêm quy định tại khoản 2.15 Phụ lục 04 ban hành kèm theo Thông tư 39/2014/TT-BTC cũng có quy định:
"2.15. Hóa đơn, chứng từ đối với tài sản góp vốn, tài sản điều chuyển được thực hiện như sau:
...
b) Bên có tài sản góp vốn, có tài sản điều chuyển là tổ chức, cá nhân kinh doanh:
b.1. Tài sản góp vốn vào doanh nghiệp phải có: biên bản góp vốn sản xuất kinh doanh, hợp đồng liên doanh, liên kết; biên bản định giá tài sản của Hội đồng giao nhận vốn góp của các bên góp vốn (hoặc văn bản định giá của tổ chức có chức năng định giá theo quy định của pháp luật), kèm theo bộ hồ sơ về nguồn gốc tài sản."
Ngoài ra, anh có thể tham khảo thêm tại Công văn sau gửi anh tham khảo: Công văn 72271/CT-TTHT năm 2019 về xuất hóa đơn đối với hoạt động góp vốn bằng tài sản cố định do Cục Thuế thành phố Hà Nội ban hành.